Компьютерное зрение против рутины: как мы ускорили анализ поведения лабораторных мышей Анализ поведения лабор…

Компьютерное зрение против рутины: как мы ускорили анализ поведения лабораторных мышей

Анализ поведения лабораторных животных во время исследований — неочевидная, но очень ресурсоёмкая задача: учёным приходится вручную просматривать сотни часов видео, фиксировать действия мышей покадрово и переносить интервалы в таблицы. Один 10-минутный ролик может занимать около часа работы, а ошибки и усталость неизбежно влияют на качество данных.

Авторы из Центра технологий для общества Yandex Cloud и Yandex Crowd Solutions рассказывают, как автоматизировали анализ поведения мышей для исследований ИЦиГ СО РАН и сэкономили учёным более 500 часов ручной работы. В статье — про кастомный интерфейс разметки, подготовку датасета, использование DeepLabCut для трекинга ключевых точек тела, обработку координат, классификацию поведения через sklearn Pipeline и XGBoost, разметку зон по координатам, сглаживание покадровых предсказаний, генерацию CSV и видео с оверлеем через OpenCV, а также веб-интерфейс для лаборантов.

#статья